Канадские ученые заявили, что теперь обладают уникальными знаниями о патогенном комплексе, вызывающим почернение корневой шейки растений рапса

Канадские исследователи секвенировали 162 расы возбудителей болезни корневой шейки растений рапса, куда входят патогенные грибы и бактерии родов Pseudomonas, Erwinia, Dickeya. Комплекс патогенов называют по особенности симптомов – черная ножка, пишет Шон Пратт в статье на портале Producer

«Ученые из МСХ Канады изучили, какие именно патогены черной ножки рапса распространены в Западной Канаде, и с помощью этих знаний они надеются предоставить производителям новые инструменты для эффективного лечения болезни, а селекционерам – уникальную информацию для создания новых сортов.

Черная ножка была впервые обнаружена в поле на северо-востоке Саскачевана в 1975 году. С тех пор болезнь имела разрушительные последствия, особенно в 1980-х и 1990-х годах, когда некоторые фермеры, производящие рапс, сообщали о потере урожая до 50 процентов.

Сорта канолы с высоким уровнем устойчивости к болезни были выведены в начале 1990-х годов, но к концу 1990-х патогены начали преодолевать эту устойчивость.

В последнее десятилетие отмечается рост черной ножки и тяжести заболевания канолы.

Соответственно, селекционеры должны иметь возможность создавать линии с повышенной устойчивостью. И теперь, когда ученые секвенировали 162 штамма патогена и лучше понимают его генетическую изменчивость и структуру популяции, работы по созданию таких сортов пойдут быстрее.

«Канадские селекционеры смогут получить более подробное представление о том, как патоген развивается в разных частях прерий, чтобы разработать сорта для лучшей защиты от патогена, - сказал Дуг Хит, руководитель исследований Комиссии по развитию канолы Саскачевана. – Благодаря открытию, ученые знают, как и какие гены рапса коррелируют с эволюцией новых рас «черной ножки». Это предлагает селекционерам мишени для поиска новых генов устойчивости».

162 штамма были отобраны из более чем 1000 рас болезни, собранных фитопатологами в трех провинциях Канадских Прерий за последние два десятилетия.

«Наша выборка очень уникальна, - говорит Фэнцюнь Юй, ведущий исследователь исследования. - Я не думаю, что кто-то еще имеет такие ресурсы».

Одной из основных целей исследования является разработка инструмента, позволяющего производителям проводить профилактику рисков на полях, зараженных черной ножкой. Ученые, получив образцы листьев или стерни рапса, изолируют штамм с помощью секвенирования генома и определят, какая из 162 рас патогена присутствует в поле, и предоставят рекомендации по сортам с устойчивостью для данного поля.

Например, образцы патогенов из Альберты и Саскачевана имели схожий генетический состав, в то время как образцы из Манитобы были сильно диверсифицированы, что усложняет борьбу с болезнью в этой провинции.

Исследователи надеются, что крупные производители канолы в стране, которым интересен данный проект, финансово поддержат доведение диагностического инструмента до коммерциализации. Ориентировочно, это произойдет через три года доработки».